Het is niet overdreven om te zeggen dat de CRISPR-Cas9-techniek voor het bewerken van genen een revolutionaire doorbraak is geweest, waardoor wetenschappers snel, gemakkelijk en nauwkeurig stukjes DNA kunnen bewerken. Maar vragen over hoe nauwkeurig de CRISPR-tool is, zijn gerezen in een nieuwe studie van het Columbia University Medical Center, die aantoont dat deze technologie voor het bewerken van genen honderden onbedoelde mutaties in het genoom kan introduceren.
CRISPR heeft geleid tot een vlaag van nieuwe wegen van onderzoek over de hele wereld, van gericht op kanker naar HIVMet eerste menselijke proeven met CRISPR-bewerkte cellen die al onderweg zijn in China en een Amerikaanse proef gepland voor 2018. Maar deze nieuwe studie roept op tot voorzichtigheid en suggereert dat we de grotere genomische effecten van de tool nog moeten begrijpen.
Het team van wetenschappers dat bij het onderzoek betrokken was, werkte eerder met de CRISPR-tool behandel een ernstige oogziekte retinitis pigmentosa genoemd, wat leidt tot blindheid. Ze besloten om het hele genoom van de CRISPR-behandelde muizen van hun vorige experimenten te onderzoeken, op zoek naar mogelijke mutaties, zelfs die mutaties die slechts een enkele nucleotide veranderden.
Over het algemeen gebruiken wetenschappers, wanneer ze proberen vast te stellen of een CRISPR-bewerking heeft geresulteerd in een mutatie of verwijdering buiten het doelwit, computeralgoritmen om gebieden te identificeren die het meest waarschijnlijk worden beïnvloed en richten hun aandacht daarop.
"Deze voorspellende algoritmen lijken goed werk te leveren wanneer CRISPR wordt uitgevoerd in cellen of weefsels in een schaal", zegt co-auteur van de studie, professor Alexander Bassuk, "maar de sequentiebepaling van het hele genoom is niet gebruikt om alle uit- doelwiteffecten bij levende dieren. "
Bij het onderzoeken van het gehele genoom van de met CRISPR behandelde muizen, ontdekten ze dat het hulpmiddel met succes het specifieke gen waarop ze zich richtten had gecorrigeerd, maar het veroorzaakte ook potentieel veel andere genetische veranderingen. Bij twee met CRISPR behandelde dieren werden meer dan 100 grote gen deleties of inserties en meer dan 1,500 enkele nucleotide mutaties geïdentificeerd.
Dit gepost op een forum direct naast een endagadget-artikel over het gebruik van CRSPR om fluorescerend bier te maken 🙂